Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2A2P16615 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms