Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB3P16520 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB3P16520 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB3P16520 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB3P16520 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB3P16520 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB3P16520 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB3P16520 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB3P16520 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB3P16520 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB3P16520 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GNB3P16520 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GNB3P16520 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GNB3P16520 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB3P16520 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 527 ms