Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSPP15924 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSPP15924 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSPP15924 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSPP15924 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSPP15924 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSPP15924 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DSPP15924 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSPP15924 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSPP15924 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSPP15924 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSPP15924 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSPP15924 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSPP15924 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSPP15924 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSPP15924 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSPP15924 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSPP15924 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSPP15924 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSPP15924 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSPP15924 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSPP15924 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSPP15924 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSPP15924 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSPP15924 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSPP15924 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSPP15924 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSPP15924 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSPP15924 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSPP15924 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DSPP15924 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSPP15924 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSPP15924 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSPP15924 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms