Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UCHL3P15374 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UCHL3P15374 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms