Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA4P13612 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA4P13612 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms