Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms