Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRFP10586 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms