Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETSIPP0DME0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SETSIPP0DME0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETSIPP0DME0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETSIPP0DME0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETSIPP0DME0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETSIPP0DME0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SETSIPP0DME0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETSIPP0DME0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETSIPP0DME0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETSIPP0DME0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETSIPP0DME0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETSIPP0DME0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SETSIPP0DME0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETSIPP0DME0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms