Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms