Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPBP07199 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPBP07199 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPBP07199 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPBP07199 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPBP07199 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPBP07199 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPBP07199 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPBP07199 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPBP07199 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPBP07199 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPBP07199 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPBP07199 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPBP07199 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPBP07199 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPBP07199 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPBP07199 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPBP07199 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPBP07199 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPBP07199 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPBP07199 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPBP07199 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPBP07199 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPBP07199 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPBP07199 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPBP07199 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPBP07199 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPBP07199 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPBP07199 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPBP07199 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPBP07199 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPBP07199 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPBP07199 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPBP07199 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPBP07199 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPBP07199 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPBP07199 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPBP07199 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPBP07199 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPBP07199 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPBP07199 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPBP07199 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPBP07199 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPBP07199 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPBP07199 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPBP07199 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPBP07199 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPBP07199 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPBP07199 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPBP07199 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPBP07199 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPBP07199 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPBP07199 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CENPBP07199 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CENPBP07199 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CENPBP07199 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CENPBP07199 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPBP07199 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPBP07199 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPBP07199 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPBP07199 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPBP07199 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPBP07199 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPBP07199 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPBP07199 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPBP07199 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPBP07199 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPBP07199 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPBP07199 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPBP07199 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPBP07199 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPBP07199 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPBP07199 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPBP07199 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms