Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPLP06858 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPLP06858 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPLP06858 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LPLP06858 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LPLP06858 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LPLP06858 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LPLP06858 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LPLP06858 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LPLP06858 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LPLP06858 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LPLP06858 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LPLP06858 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LPLP06858 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LPLP06858 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LPLP06858 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LPLP06858 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LPLP06858 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPLP06858 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms