Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TUBB4AP04350 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms