Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCNP04198 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCNP04198 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCNP04198 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCNP04198 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCNP04198 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCNP04198 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCNP04198 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCNP04198 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCNP04198 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCNP04198 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCNP04198 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCNP04198 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCNP04198 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCNP04198 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCNP04198 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCNP04198 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYCNP04198 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MYCNP04198 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYCNP04198 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYCNP04198 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYCNP04198 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYCNP04198 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYCNP04198 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms