Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCAP01258 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCAP01258 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCAP01258 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCAP01258 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCAP01258 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCAP01258 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCAP01258 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCAP01258 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCAP01258 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCAP01258 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCAP01258 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCAP01258 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCAP01258 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCAP01258 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCAP01258 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCAP01258 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCAP01258 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCAP01258 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCAP01258 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCAP01258 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCAP01258 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCAP01258 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCAP01258 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCAP01258 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCAP01258 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCAP01258 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCAP01258 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCAP01258 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCAP01258 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCAP01258 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCAP01258 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCAP01258 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCAP01258 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCAP01258 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCAP01258 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCAP01258 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCAP01258 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCAP01258 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCAP01258 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCAP01258 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCAP01258 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCAP01258 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCAP01258 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCAP01258 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCAP01258 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCAP01258 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCAP01258 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCAP01258 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCAP01258 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCAP01258 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCAP01258 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCAP01258 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCAP01258 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCAP01258 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCAP01258 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCAP01258 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCAP01258 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCAP01258 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCAP01258 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCAP01258 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCAP01258 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCAP01258 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCAP01258 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCAP01258 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCAP01258 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCAP01258 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCAP01258 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCAP01258 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCAP01258 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms