Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P00740 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P00740 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P00740 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P00740 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P00740 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P00740 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P00740 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P00740 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P00740 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P00740 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P00740 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P00740 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P00740 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P00740 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P00740 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P00740 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P00740 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P00740 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P00740 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P00740 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P00740 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P00740 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P00740 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P00740 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P00740 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
F9P00740 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F9P00740 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F9P00740 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F9P00740 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F9P00740 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
F9P00740 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F9P00740 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F9P00740 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
F9P00740 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F9P00740 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F9P00740 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F9P00740 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F9P00740 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F9P00740 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F9P00740 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F9P00740 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F9P00740 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P00740 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P00740 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P00740 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P00740 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P00740 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P00740 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P00740 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P00740 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P00740 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P00740 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms