Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLDN7O95471 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms