Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF4AO95239 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms