Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALDH1A2O94788 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms