Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLOT1O75955 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FLOT1O75955 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FLOT1O75955 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FLOT1O75955 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FLOT1O75955 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FLOT1O75955 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FLOT1O75955 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms