Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCATO75600 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCATO75600 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCATO75600 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCATO75600 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCATO75600 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCATO75600 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCATO75600 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCATO75600 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCATO75600 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCATO75600 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCATO75600 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCATO75600 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCATO75600 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCATO75600 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCATO75600 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCATO75600 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCATO75600 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCATO75600 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCATO75600 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCATO75600 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCATO75600 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCATO75600 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCATO75600 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCATO75600 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCATO75600 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCATO75600 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCATO75600 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCATO75600 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCATO75600 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCATO75600 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCATO75600 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCATO75600 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCATO75600 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCATO75600 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCATO75600 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCATO75600 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCATO75600 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCATO75600 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCATO75600 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCATO75600 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCATO75600 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCATO75600 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCATO75600 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCATO75600 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCATO75600 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCATO75600 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCATO75600 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCATO75600 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCATO75600 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCATO75600 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCATO75600 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCATO75600 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCATO75600 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCATO75600 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GCATO75600 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCATO75600 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCATO75600 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCATO75600 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCATO75600 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCATO75600 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCATO75600 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCATO75600 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCATO75600 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCATO75600 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCATO75600 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCATO75600 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCATO75600 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCATO75600 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms