Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNSO60931 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNSO60931 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNSO60931 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNSO60931 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNSO60931 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNSO60931 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNSO60931 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNSO60931 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNSO60931 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNSO60931 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNSO60931 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNSO60931 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNSO60931 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNSO60931 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNSO60931 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNSO60931 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNSO60931 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNSO60931 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms