Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN3BO60391 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GRIN3BO60391 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms