Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VEGFDO43915 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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VEGFDO43915 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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VEGFDO43915 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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VEGFDO43915 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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VEGFDO43915 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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VEGFDO43915 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VEGFDO43915 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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VEGFDO43915 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VEGFDO43915 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VEGFDO43915 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VEGFDO43915 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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VEGFDO43915 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VEGFDO43915 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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