Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSTPIP1O43586 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSTPIP1O43586 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSTPIP1O43586 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSTPIP1O43586 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSTPIP1O43586 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSTPIP1O43586 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms