Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBFA2T2O43439 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFA2T2O43439 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms