Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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