Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms