Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN2DO15399 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms