Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP290O15078 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP290O15078 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP290O15078 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP290O15078 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP290O15078 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP290O15078 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP290O15078 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP290O15078 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP290O15078 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP290O15078 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP290O15078 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP290O15078 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP290O15078 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP290O15078 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP290O15078 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP290O15078 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP290O15078 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP290O15078 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP290O15078 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP290O15078 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP290O15078 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP290O15078 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP290O15078 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP290O15078 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP290O15078 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP290O15078 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP290O15078 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP290O15078 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP290O15078 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP290O15078 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP290O15078 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP290O15078 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP290O15078 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP290O15078 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP290O15078 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP290O15078 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP290O15078 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP290O15078 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP290O15078 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP290O15078 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP290O15078 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP290O15078 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP290O15078 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP290O15078 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP290O15078 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP290O15078 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP290O15078 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP290O15078 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP290O15078 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP290O15078 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP290O15078 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP290O15078 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP290O15078 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP290O15078 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP290O15078 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP290O15078 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP290O15078 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP290O15078 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP290O15078 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP290O15078 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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