Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SYNJ2O15056 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms