Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R1O14745 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC9A3R1O14745 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3R1O14745 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3R1O14745 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3R1O14745 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3R1O14745 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3R1O14745 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3R1O14745 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3R1O14745 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3R1O14745 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3R1O14745 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms