Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms