Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIP1O00291 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIP1O00291 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIP1O00291 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIP1O00291 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIP1O00291 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIP1O00291 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIP1O00291 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIP1O00291 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIP1O00291 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIP1O00291 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIP1O00291 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIP1O00291 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIP1O00291 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIP1O00291 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIP1O00291 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIP1O00291 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIP1O00291 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIP1O00291 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIP1O00291 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIP1O00291 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIP1O00291 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIP1O00291 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIP1O00291 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIP1O00291 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIP1O00291 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIP1O00291 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HIP1O00291 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIP1O00291 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIP1O00291 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIP1O00291 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIP1O00291 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIP1O00291 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIP1O00291 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIP1O00291 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIP1O00291 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIP1O00291 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIP1O00291 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIP1O00291 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIP1O00291 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIP1O00291 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIP1O00291 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIP1O00291 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIP1O00291 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIP1O00291 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIP1O00291 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIP1O00291 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIP1O00291 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIP1O00291 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIP1O00291 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HIP1O00291 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIP1O00291 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIP1O00291 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HIP1O00291 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIP1O00291 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HIP1O00291 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIP1O00291 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIP1O00291 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIP1O00291 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIP1O00291 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIP1O00291 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIP1O00291 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIP1O00291 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIP1O00291 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIP1O00291 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIP1O00291 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIP1O00291 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIP1O00291 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HIP1O00291 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIP1O00291 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HIP1O00291 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIP1O00291 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIP1O00291 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIP1O00291 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIP1O00291 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIP1O00291 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIP1O00291 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HIP1O00291 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HIP1O00291 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIP1O00291 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIP1O00291 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIP1O00291 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIP1O00291 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms