Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF103O00237 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF103O00237 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF103O00237 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF103O00237 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF103O00237 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF103O00237 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF103O00237 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF103O00237 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF103O00237 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF103O00237 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF103O00237 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF103O00237 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF103O00237 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF103O00237 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF103O00237 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF103O00237 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF103O00237 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF103O00237 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF103O00237 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF103O00237 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF103O00237 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF103O00237 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF103O00237 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF103O00237 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF103O00237 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF103O00237 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF103O00237 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF103O00237 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF103O00237 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF103O00237 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF103O00237 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF103O00237 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF103O00237 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF103O00237 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF103O00237 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF103O00237 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF103O00237 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF103O00237 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF103O00237 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF103O00237 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF103O00237 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF103O00237 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF103O00237 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF103O00237 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF103O00237 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF103O00237 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF103O00237 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF103O00237 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF103O00237 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF103O00237 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF103O00237 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF103O00237 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF103O00237 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF103O00237 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF103O00237 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms