Protein–RNA interactions for Protein: O00212

RHOD, Rho-related GTP-binding protein RhoD, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHODO00212 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHODO00212 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHODO00212 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHODO00212 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHODO00212 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHODO00212 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHODO00212 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHODO00212 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms