Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBXN8O00124 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms