Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms