Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9J4A7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9J4A7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C9J4A7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9J4A7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C9J4A7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9J4A7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9J4A7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9J4A7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C9J4A7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9J4A7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9J4A7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9J4A7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9J4A7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9J4A7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9J4A7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9J4A7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9J4A7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9J4A7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9J4A7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9J4A7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9J4A7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9J4A7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C9J4A7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9J4A7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9J4A7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9J4A7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9J4A7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9J4A7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9J4A7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9J4A7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9J4A7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9J4A7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9J4A7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9J4A7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9J4A7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9J4A7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C9J4A7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9J4A7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9J4A7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9J4A7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms