Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD1B0YJ81 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms