Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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