Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
YJEFN3A6XGL0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms