Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms