Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms