Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERINC4A6NH21 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms