Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms