Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NDN8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A6NDN8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NDN8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NDN8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms