Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms