Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms