Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AL161672.1-201ENST00000450968 818 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 NDUFB5-205ENST00000472629 744 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC136628.2-201ENST00000505650 1142 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 TRIT1-215ENST00000541099 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC087878.1-201ENST00000560709 574 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 CTBP2P7-201ENST00000593270 1244 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 FAM236A-202ENST00000611003 403 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC008735.4-201ENST00000614815 608 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC091167.7-201ENST00000622269 518 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC092471.2-201ENST00000637219 651 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 FITM2-201ENST00000396825 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AL645568.1-201ENST00000367716 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 SMS-202ENST00000404933 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 ILK-215ENST00000537806 1801 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 UBIAD1-202ENST00000376810 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC010201.2-201ENST00000605595 1495 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 GABBR1-203ENST00000377012 4104 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 RIPOR1-202ENST00000379312 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 RHO-201ENST00000296271 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 MAPK9-205ENST00000397072 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 KNOP1P4-201ENST00000445020 1438 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 FCRL1-201ENST00000358292 2778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 HS6ST2-202ENST00000370836 4441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 ETFDH-201ENST00000307738 1903 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AL132639.2-201ENST00000605298 1359 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 UPF3B-204ENST00000619445 1385 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 SPATA18-201ENST00000295213 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 MPP3-202ENST00000398393 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 ITIH5-209ENST00000613909 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 PAX8-AS1-205ENST00000437551 2390 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AP000787.1-206ENST00000543150 1567 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 PDIA6-208ENST00000617249 2344 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 RPL10A-201ENST00000322203 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 SNCA-202ENST00000345009 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 OOEP-202ENST00000370363 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 RNA5SP244-201ENST00000390936 112 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 RN7SKP297-201ENST00000411270 282 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 ARHGEF9-IT1-201ENST00000420917 394 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AL365258.2-201ENST00000447479 472 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AP000522.1-201ENST00000448070 121 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AL158824.1-201ENST00000451825 450 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 VOPP1-212ENST00000454227 610 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 EHMT1-210ENST00000478940 591 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 RBMXP4-201ENST00000507797 1134 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 CD63-215ENST00000552754 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 ZBTB25-203ENST00000555424 565 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC013489.2-201ENST00000558732 276 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 HPR-203ENST00000561690 634 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 PIMREG-209ENST00000576056 833 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 TMEM95-203ENST00000576060 622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 TEX26-AS1-206ENST00000586464 851 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 SLC25A1P5-201ENST00000587610 783 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC020913.1-202ENST00000599360 467 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 SAMMSON-221ENST00000641715 1546 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC078925.3-201ENST00000623434 2500 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 ETFDH-206ENST00000511912 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 SLC12A4-203ENST00000537830 3525 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 ITSN1-211ENST00000399355 4003 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 HNRNPR-202ENST00000374612 2694 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 LONRF2-202ENST00000409647 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TMEM107-208ENST00000532998 2358 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 UFSP2-201ENST00000264689 1630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC012313.5-201ENST00000594816 2517 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 BTG2-201ENST00000290551 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms