Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U3

SCIN, Adseverin, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCINQ9Y6U3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCINQ9Y6U3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCINQ9Y6U3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCINQ9Y6U3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCINQ9Y6U3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCINQ9Y6U3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCINQ9Y6U3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCINQ9Y6U3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCINQ9Y6U3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1232.2 ms